Seguì poi l’epoca dei Comuni, e fu proprio in questo periodo che il nostro paese acquisì una certa importanza: fin dal 1210 si trova citata la Contrada, o il Comune di Sambusita, che era chiamata Costa, o Costa di Sambusita. Per tutto il 1200 e il 1300 fu l’abitato più importante della Valle Brembana Superiore, come veniva chiamata la Val Serina. In questa prima fase dell’epoca comunale, oltre a Dossena, furono Lepreno e Costa i primi a darsi uno statuto comunale, costituendo due raggruppamenti: con Lepreno erano collegati Serina, Frerola, Pagliaro, Bracca e Cornalta; Costa comprendeva Sambusita e Rigosa: non si parla ancora di Ascensione, Trafficanti e Ambriola, ma nella Costa di Sambusita era compreso tutto il territorio a sinistra del torrente Serina. 

Nel corso del ’400, con l’avvento della Repubblica Veneta, il territorio venne riorganizzato: fu stabilito un Vicario a Serina, e fu allora che la Costa iniziò ad essere chiamata Costa di Serina. Il documento scritto più importante che ci rimane dal dominio veneto è un resoconto del 1596 del capitano di Bergamo Giovanni da Lezze, indirizzato al Senato. In esso viene descritta anche la Costa, con le sue contrade: “Costa di Sopra, Algua, Algazio, L’Ambria, Salmeza, Taiada, Canto, Salvin, Ruspin, Fondria, Comolta, Piaza, Nespel. Vi sono 210 famiglie con 881 abitanti. Si parla poi di boschi e pascoli goduti in uso comune sul monte Suchello, mentre quelli della Val Pagana sono propri del comune.

La peste del 1630 fu particolarmente dannosa per la Valle Brembana Superiore, che secondo quanto riportato in un vecchio manoscritto “corse pericolo di restare spopolata e quasi deserta”. Tra i paesi della nostra zona, la Costa pago il tributo di morte più di tutti. La sua popolazione uscì dimezzata da questa catastrofe: morirono a causa della peste 334 persone e ne rimasero in vita 329. Nel XVIII secolo fu definita nel Comune di Costa Serina una nuova struttura di governo. Nel 1753 entrò infatti in vigore l’ultima edizione degli Statuti nel periodo della Repubblica Veneta, una copia dei quali è stata ritrovata nel 1972 in una cassapanca di proprietà di Angelo Gherardi del Predasso di Ascensione. Nel periodo che va dalle Guerre di indipendenza alle due Guerre mondiali, anche il nostro comune fu pienamente coinvolto nelle vicende che riguardavano direttamente l’Italia. Non mancarono nella zona persone che aderivano alla Carboneria nel periodo pre-unitario, in contrapposizione al dominio austriaco.